Yo los tonos me los creo con la app Garageband, que ya viene incluida en el Iphone... Y después sí los uso para personalizar los sonidos de contacto en whatsapp, por ejemplo.
Si ya tienes creados ringtones personalizados, entiendo que te refieres a como usarlos como tonos en ciertos contactos, en whatsapp, por ejemplo, verdad?
Si es así, se hace de la siguiente manera:
En Whatsapp vas al contacto que quieres ponerle el tono
Una vez ahí, vas al apartado Fondo de pantalla y sonido
Y ahí dentro en Personalizar tono > Tono de alerta y ahí escoges el que quieras.